Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDIT4Q9NX09 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms