Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms