Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms