Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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