Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PREBQ9HCU5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms