Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1Q9HAT0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms