Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms