Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF17Q9BXT8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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