Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms