Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms