Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM29Q9BSF4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms