Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms