Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms