Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms