Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms