Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms