Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms