Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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