Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD180Q99467 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CD180Q99467 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CD180Q99467 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD180Q99467 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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