Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms