Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC42Q96M95 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms