Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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C2orf48Q96LS8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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