Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms