Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms