Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN23Q96B33 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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