Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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