Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms