Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEO1Q92859 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEO1Q92859 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms