Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms