Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms