Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms