Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms