Protein–RNA interactions for Protein: Q86V20

FAM35A, Protein FAM35A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM35AQ86V20 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms