Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms