Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms