Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.4 ms