Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VITQ6UXI7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms