Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms