Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms