Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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