Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms