Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

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Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KCNT1Q5JUK3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KCNT1Q5JUK3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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