Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB6CQ53S08 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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