Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms