Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms