Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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