Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms