Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GRIK5Q16478 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GRIK5Q16478 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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