Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCN9AQ15858 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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