Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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